デジタルPCRによる超高感度腫瘍由来循環
DNA測定用「OTS-Probes」

デジタルPCRによる超高感度腫瘍由来循環DNA測定用「OTS-Probes」

「OTS-Probes」は、株式会社クオントディテクト（以下QD社）が開発、製造するデジタルPCR用プライマー・プローブ試薬です。「OTS」は「off-the-shelf（すぐに使える）」の略で、この試薬の特長を表しています。

がん患者の血液中にはがん由来DNA(ctDNA)が極めて微量に含まれていますが、この微量な量を検出するには、通常のPCR法や次世代シークエンサーでは一般に難しい濃度となっています。
デジタルPCRでは超高感度に測定できる為、ctDNAの濃度測定が可能な範囲に入りますが、ライブラリー化されたデジタルPCR用プライマー・プローブの開発が必要でした。

この度、QD社が血液中のがん由来DNA測定を目的として超高感度デジタルPCR法に特化したライブラリー試薬として「OTS-Probes」を開発しました。

フィンガルリンクはQD社と独占販売契約を締結し、世界に先駆けてOTS-Probesの国内での販売を開始します。

様々な遺伝子変異が目的に応じてライブラリー化されており、研究者の方々の目的に合った選定が可能になっています。

これらライブラリーに含まれるプローブの多くは、ヒト由来DNAを用いて動作確認およびPCR条件設定が完了しています。また、ほとんどのプローブは同一のPCR条件となるよう設計されています。試薬がお手元に届き次第、複雑な条件設定なしに使用することができるのが、その名の通り「OTS-Probes」の特徴です。

対応可能なデジタルPCRのシステムは以下の通りです。

BIO-Rad社 QX200 Droplet Digital PCR system
Thermo Fisher Scientific社 QuantStudio 3D Digital PCR system
Thermo Fisher Scientific社 QuantStudio Absolute Q Digital PCR system

【また、一部プローブではポジティブコントロール DNAもご用意しております】

▷ 研究用「OTS-Probes」リスト

PDFリストリンク

※ライブラリーの内容は予告なく変更になる場合があります。

「OTS-Probes」に関するお問い合わせは下記までお願いします。

OTS-Probesを用いた自由診療「 OTS-アッセイ」が岩手医科大学附属病院で実施されています。
関連ウェブサイトはこちらから。

https://www.quantdetect.com/
https://www.hosp.iwate-med.ac.jp/hospital/gancenter/service/genome.html#ots
https://www.securite.jp/fund/detail/7523

OTS-アッセイに関連する文献

Early dynamics of circulating tumor DNA predict chemotherapy responses for patients with esophageal cancer. Fujisawa R, et al. Carcinogenesis. 2021 Oct 26;42(10):1239-1249.
Reply. Iwaya T and Nishizuka SS. Gastroenterology. 2021 Jul;161(1):367-368.
Frequent post-operative monitoring of colorectal cancer using individualized ctDNA validated by multi-regional molecular profiling. Yaegashi M, et al. Br J Cancer. 2021 Apr;124(9):1556-1565.
Frequent Tumor Burden Monitoring of Esophageal Squamous Cell Carcinoma With Circulating Tumor DNA Using Individually Designed Digital Polymerase Chain Reaction. Iwaya T, et al. Gastroenterology. 2021 Jan;160(1):463-465.e4.
Analysis of mutational and proteomic heterogeneity of gastric cancer suggests an effective pipeline to monitor post-treatment tumor burden using circulating tumor DNA. Sasaki N, et al. PLoS One. 2020 Oct 7;15(10):e0239966.
A Pipeline for ctDNA Detection Following Primary Tumor Profiling Using a Cancer-Related Gene Sequencing Panel. Nishizuka SS, Sato KA, Hachiya T. Methods Mol Biol. 2019;1908:229-241.